خطراتی که این منطقه را تهدید می‌کند فقط به تعداد بالای توریست‌ها محدود نمی‌شود. در سال ۲۰۱۷ برنامه‌ای برای استخراج نفت از فاصله ۶۴ کیلومتری رودخانه توسط رئیس جمهور وقت یعنی خوان مانوئل سانتوس رد شد؛ چون به نظر می‌رسید که این عملیات باعث آسیب رسیدن به رودخانه می‌شود. جدال بین دولت و شرکت نفت تگزاس اکنون به دادگاه منتقل شده است.

یکی دیگر از مشکلاتی که برای طبیعت کلمبیا مطرح می‌شود، جنگل زدایی است که منطقه La Macarena نیز از آن مستثنی نیست. جنگل زدایی باعث تاثیرگذاری روی الگوی بارش باران می‌شود و در نتیجه باران کمتری در منطقه می‌بارد. به همین دلیل آب رودخانه از آب شفاف و زلال به آب تیره تبدیل می‌شود و گونه گیاهی موجود در بستر رودخانه را در معرض خطر انقراض قرار می‌دهد.

خوشبختانه اهالی منطقه بیشتر از قبل در مورد طبیعت اطراف خود آگاهی پیدا کرده‌اند و در تلاش‌اند تا از آن محافظت کنند.

بازدید از رودخانه

 بدون راهنمای تور دارای مجوز از دولت، نمی‌توانید از این رودخانه بازدید کنید. در دفتر پارک ملی می‌توانید از قبل مجوز ورود برای بازدید از آن را دریافت کنید. تعداد کمی از گردشگران می‌توانند در طول روز از طریق پارک ملی از رودخانه بازدید کنند و بیشتر ظرفیت بازدید در اختیار آژانس‌های توریستی قرار دارد. در نتیجه باید با استفاده از تورهای این آژانس‌ها برای بازدید از این منطقه اقدام کنید.

بیشتر تورها ۲ تا ۴ روزه هستند و گردشگران را به اطراف پارک ملی و رودخانه می‌برند. نزدیک‌ترین شهر به این رودخانه شهر La Macarena است. امکان چادر زدن و کمپینگ در پارک وجود ندارد و برای اقامت باید به همین شهر سر بزنید که امکانات اقامتی ساده و محدودی دارد. برای بازدید از این منطقه باید در برابر تب زرد واکسینه شده باشید و قرص ضدمالاریا مصرف کرده باشید.